Un'altra ipotesi (Fernandez e Ip, 1983) lega la formazione della Nube di Oort all'aggregazione più lenta di Urano e Nettuno rispetto agli altri pianeti.   Nella zona di formazione di questi pianeti vi era una elevata disponibilità di planetesimi ed il meccanismo di aggregazione era caratterizzato da una bassa efficienza a causa dell'assenza di gas (situazione ben diversa da quella che aveva portato alla rapidissima accrezione di Giove e, successivamente, di Saturno).  Questi due fattori avrebbero fatto sì che i planetesimi potessero risentire degli effetti gravitazionali di Urano e Nettuno (anche se di dimensioni inferiori alle attuali) a tal punto da essere lanciati su orbite già paragonabili a quelle dei corpi costituenti la Nube di Oort.
Si può comunque affermare che la Nube Esterna di Oort segna il confine del Sistema Solare ed è plausibile pensare che essa possa estendersi fino a coprire circa 1/3 della distanza da Proxima Centauri, vale a dire circa 80.000 U.A. 
E' inevitabile che a queste enormi distanze dal Sole le comete possano facilmente essere perturbate nel loro moto.  I due fattori fondamentalmente responsabili della perturbazione del moto sono:

Le recentissime scoperte di oggetti tipo-Halley nella Kuiper Belt (Cochran et al., 1995) e le valutazioni dinamiche sulla popolazione ivi collocata (Stern, 1995) non fanno altro che deporre a favore della prima ipotesi. L'analisi dinamica, inoltre, suggerisce che la popolazione cometaria non sia primordiale, bensì il prodotto di un processo collisionale a cascata, che ha rifornito il numero di piccoli corpi (~ 1 km) inizialmente carente. Accettando, però, per le comete a corto periodo una origine più prossima a noi della Nube di Oort non possiamo non ipotizzare per esse una composizione chimica che le possa differenziare dalle comete a lungo periodo.
Un tassello certamente da non trascurare di questo mosaico che si va componendo è proprio la recente scoperta della forte presenza di etano (C2H6) prodotta dalla zona nucleare della cometa Hyakutake, già interpretata proprio come discriminante di possibili differenziate tipologie di comete (Mumma et al., 1996).
Studi di laboratorio relativi alla possibilità di intrappolamento di gas durante la formazione di ghiaccio a temperature molto basse vengono utilizzati per simulare i meccanismi di formazione dei nuclei cometari a diverse distanze dal Sole e a tale proposito si è notato che la temperatura gioca un ruolo fondamentale sia per quanto riguarda la quantità totale dei gas sia le relative proporzioni.  Poichè la cattura di N₂ è inefficiente, tutti i planetesimi formatisi allinterno di Nettuno sarebbero caratterizzati da carenza di azoto, somigliando in tal modo, per quanto riguarda i valori del rapporto C/N, ai pianeti interni.
Dall'analisi di questo rapporto, Owen e Bar-Nun (1995) traggono spunto per ipotizzare, in virtù del luogo dorigine, tre differenti tipologie cometarie:

(*) alcune di esse nella Nube di Oort.

Per quanto riguarda la composizione chimica, i due ricercatori propongono i seguenti tratti caratteristici per le diverse tipologie delle comete:

Suggeriscono inoltre che anche il rapporto N₂ / CO possa fornire indicazioni sul luogo d'origine della cometa in quanto le comete "nuove" (provenienti cioè dalla Nube di Oort) presenterebbero valori di tale rapporto sistematicamente più elevati di quelli rilevabili per le comete a corto periodo.
Tale previsione viene collegata ad un duplice meccanismo di produzione di CO: da un lato vi è una sorgente di tipo molecolare (una possibile molecola-madre può essere H₂CO) caratterizzata da una produzione sostanzialmente costante, dall'altro lato una sorgente diretta, la perdita, cioè, di gas intrappolato nei ghiacci cometari, il cui rilascio è molto rapido. I ripetuti passaggi al perielio finirebbero con lo svuotare la cometa dei gas intrappolati (CO e N₂), mentre la produzione molecolare rimarrebbe pressochè invariata e questo fatto comporterebbe la diminuzione del rapporto N₂ / CO.
Si potrebbe, inoltre, ricondurre lelevato valore del rapporto C/N tipico dell'atmosfera della Terra e di Venere all'apporto di materiale da parte delle comete di tipo I, mentre l'apporto dei gas nobili deve necessariamente essere spiegato con le altre tipologie cometarie.
Acquista dunque importanza cruciale, tentando di ricostruire la composizione delle atmosfere planetarie originarie, la valutazione dell'apporto degli oggetti di tipo cometario attraverso il meccanismo degli impatti; sono questi eventi che hanno contribuito in modo determinante alla composizione delle atmosfere dei pianeti di tipo terrestre.   E un dato ormai accettato da tutti, infatti, che le attuali atmosfere dei pianeti di tipo terrestre non sono quelle primitive, ma, nel corso del tempo, si sono susseguite varie atmosfere la cui formazione e rimozione è stata pesantemente governata dagli episodi impattivi. Probabilmente l'unico corpo dell'intero Sistema Solare che ha trattenuto l'atmosfera originaria è Titano (Taylor, 1992), e a tale proposito si spera darà indicazioni esaurienti il modulo Huygens (parte integrante della missione Cassini) destinato a posarsi sulla superficie del satellite di Saturno nel novembre 2004.
Una delle difficoltà da superare nel tentativo di ricostruire la composizione delle atmosfere planetarie primitive è data dalla presenza di inevitabili reazioni chimiche tra i vari componenti, con la conseguente alterazione delle sostanze presenti. A questa tipologia di mutazioni sfuggono i gas nobili, e questa peculiarità li rende ottimi e attendibili indicatori per i tentativi di ricostruzione della composizione originaria. La provenienza di Argo, Krypton e Xeno è sempre stata tradizionalmente individuata nei fenomeni meteoritici, ma un problema irrisolto era rendere ragione della bassa abbondanza dello Xeno rispetto agli altri gas. La spiegazione proposta da Owen e Bar-Nun (1995) è che l'apporto imputabile alla sorgente meteorica (condriti carbonacee) sia tale da giustificare le quantità attualmente rilevabili di Xeno e, pertanto, si debba ricercare una sorgente addizionale in grado di rendere ragione della maggiore abbondanza di Argo e Krypton, sorgente che i due ricercatori identificano proprio nel contributo cometario nel periodo iniziale di intenso bombardamento.
Un aspetto estremamente importante del problema dell'apporto cometario all'attuale composizione del nostro pianeta è legato alla individuazione della provenienza dell'acqua, elemento indispensabile per lo sviluppo della vita, ma l'approfondimento di tale discorso è rimandato alla trattazione più generale del problema degli impatti di comete e asteroidi con la Terra.

La terza causa della scomparsa di una cometa può identificarsi nella modifica dell'orbita, fatto che può comportare sia la possibile espulsione dal Sistema Solare, sia l'evento più traumatico di un impatto con un altro corpo celeste (fatto non così raro come può sembrare). La presenza di piccoli crateri perfettamente allineati (ne sono stati rinvenuti su Callisto, Ganimede e sulla Luna stessa) fu inizialmente interpretata come causata dalla ricaduta di materiale a seguito di un impatto di un grosso asteroide (avvenuto in modo radente per giustificare l'asimmetria della struttura), ma si evidenziavano spesso grosse difficoltà nell'identificazione del cratere primario, le cui dimensioni, tra l'altro, avrebbero dovuto essere tutt'altro che trascurabili. L'evento Shoemaker-Levy (luglio 1994) ha, però, fatto abbandonare quest'ipotesi facendo propendere per la distruzione di nuclei cometari provocata dallazione di marea del pianeta a seguito di un passaggio ravvicinato (entro il limite di Roche).
Il calcolo del tasso di distruzione di comete da parte di Giove è stato affrontato da H.J. Melosh e P.Schenk, i quali hanno calcolato una media di un evento ogni 80 anni; hanno avanzato anche ipotesi riguardo alla Terra (un evento ogni 20 mila anni), ma in questo caso la statistica è ridotta a soli due casi rilevati sulla superficie del nostro satellite (Lamberti, 1996).
E' recente l'annuncio della scoperta di una catena di crateri da impatto anche sulla Terra, in Ciad; i crateri sono stati scoperti grazie alle immagini radar del sistema Spaceborn Imaging Radar C/X-band Syntetic Aperture Radar installato a bordo dello Shuttle Endeavour nell'aprile e nell'ottobre 1994: le immagini rivelano appunto due nuovi crateri (da confermare con analisi del terreno) presso quelli già conosciuti e chiamati Aorounga nel nord del Ciad. L'identificazione di questi segni da impatto è però ancora soggetta ad indagini e non ha ancora ottenuto una conferma definitiva, anche se vi è già chi (A. Ocampo del J.P.L. e K. Pope del Geo Eco Arc Research) ipotizza per l'evento una datazione di 360 milioni di anni fa (epoca per altro interessata da una delle grandi estinzioni di massa che hanno caratterizzato la storia del nostro pianeta) (Caprara, 1996). Permangono comunque ancora molti dubbi circa l'origine cometaria in quanto il meccanismo di distruzione mareale funziona perfettamente anche nel caso di asteroidi non compatti, formati da più corpi tenuti assieme dalla reciproca gravità; l'unica differenza potrebbe essere individuata nelle dimensioni finali degli oggetti originatisi dalla disgregazione, che, nel caso di corpi asteroidali, potrebbero essere caratterizzati da dimensioni anche notevoli, mentre per i nuclei cometari si ritiene che i frammenti debbano avere dimensioni molto ridotte (i frammenti della Shoemaker-Levy caduti su Giove avevano diametro massimo di 2-3 km). Ma ritorniamo ad occuparci più in dettaglio dei meccanismi che possono modificare l'orbita originaria di una cometa.  Che i pianeti (soprattutto quelli di massa maggiore o più distanti dal Sole) potessero avere un ruolo importantissimo nella perturbazione delle orbite di altri corpi celesti era già stato supposto da P. S. de Laplace, il quale introdusse a questo proposito il concetto di sfera di attività, intendendo con questo termine quella sfera, concentrica al pianeta, entro la quale l'azione gravitazionale del Sole diventava inferiore a quella del pianeta stesso (il raggio della sfera di attività di un generico pianeta è dato dalla formula: R_P= a_P* (M_P/M_Sol)^2/5). Anche un calcolo approssimato della formula di Laplace ci permette di osservare come i pianeti di massa maggiore non siano automaticamente quelli più influenti: nel grafico riportato in Figura 12 si può notare infatti l'importanza che riveste Nettuno grazie alla sua enorme distanza dal Sole (4.5 miliardi di km).
La perturbazione delle orbite è sempre stato oggetto di studio e di analisi (è l'irrisolto problema degli n corpi della Meccanica Celeste); nel caso delle comete, poi, la situazione perturbativa è notevolmente aggravata dall'esigua massa di questi corpi celesti. E' evidente che quanto più una cometa si avvicinerà alla sfera di attività di un pianeta, tanto più la sua orbita originaria potrà subire sostanziali modifiche. Questo, ovviamente, non significa automaticamente trasformazione di una cometa nuova (cioè che proviene per la prima volta dalla Nube di Oort o dalla Fascia di Kuiper) in una cometa a corto periodo, talvolta può comportare, anzi, l'immissione della cometa su un'orbita iperbolica o parabolica (con la conseguente espulsione dal Sistema Solare) oppure su una orbita di collisione con il Sole o con qualche altro pianeta (ed il citato impatto della Shoemaker-Levy 9 con Giove del luglio 1994 ne è un significativo esempio). La situazione dinamica illustrata nella Figura 13 (Maffei, I mostri del cielo, pag. 26, fig. 5) non è riferita ad alcuna cometa reale, ma mostra come dallorbita originaria la cometa si trasferisca su un'orbita differente e, conseguentemente, quella che in origine era la zona del perielio diventa, a seguito dell'azione del pianeta, l'afelio della nuova orbita. Se questa azione perturbatrice porta la cometa all'interno della zona planetaria del Sistema Solare è inevitabile che il meccanismo descritto in precedenza si possa ripetere con altri pianeti (Giove ha ora l'influenza maggiore) e si parla in questo caso di cattura graduale. Il meccanismo appena descritto genera per ogni pianeta perturbatore una famiglia di comete, tutte caratterizzate dagli afeli nei pressi dell'orbita del pianeta: a tal proposito la Figura 14 (Maffei, I mostri del cielo, pag.27, fig. 6) mostra le orbite di alcune comete appartenenti alla famiglia di Giove.